O emprego da endoscopia digestiva em pequenos animais vem se tornando cada vez mais popular como auxílio diagnóstico das afecções gastrointestinais que acometem cães e gatos. A acessibilidade direta ao lúmen do trato gastrointestinal em conjunto com a realização de biópsia da mucosa aumenta o potencial de conclusão diagnóstica. O exame histopatológico das biópsias guiadas por endoscopia de estômago e intestinos é fundamental para distinguir e classificar os tipos de lesões visibilizadas macroscopicamente pela endoscopia. No entanto, é importante a expertise do profissional no momento da coleta, pois em alguns casos estas biópsias podem ser superficiais ou pouco elucidativas em relação ao tipo de afecção